净种的目的是去掉种子中的混杂物，如果鳞、果皮、果柄、种翅、枝叶碎片、空粒、土块、破碎种子及异类种子等，以利于种子贮藏、运输和播种。
根据种子和夹杂物的比重或大小不同，分别采用风选、筛选、水选和粒选净种。
1.风选 适用于中、小粒种子，由于饱满种子与夹杂物的重量不同，利用风力将它们分离。风选的工具有风车、簸箕等。
2.筛选 利用种子与夹杂物的大小不同，选用各种孔径的筛子清除夹杂物。实际工作中，由于筛选不易分离与种子大小相似的夹杂物，还应配合风选、水选净种。
3.水选 利用种粒与夹杂物比重不同的净种方法。如银杏、侧柏、栎类、花椒及豆科的树种，可将种子浸入水中，稍加搅拌后良种下沉，杂物及空粒、秕粒、虫蛀粒均上浮，很易分离。根据种子的比重不同，还可采用盐水、黄泥水、硫酸铜、硫酸铵等溶液选种。
油脂含量高的种子不宜水选。水选的时间不可过久，以免种子吸收过多的水分和上浮的杂物吸水后下沉。经过水选的种子不能日晒，一般进行阴干后再贮藏。
4.粒选 是从种子中挑选粒大、饱满、色泽正常、没有病虫害的种子。这种方法适用于核桃、板栗、油桐、油茶等大粒种子的净种。
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